吉林省擁有各類自然保護區46個，其中，國家級自然保護區22個，省級自然保護區17個，市、縣級自然保護區7個，自然保護區總面積137.41萬公頃。自1960年建立長白山自然保護區開始，吉林省自然保護區建設經歷了從無到有、從小到大、從單一到綜合的發展歷程，依據我省區域生態狀況和生態環境總體特點，基本形成了具有梯次結構較為合理、類型較為齊全的自然保護區體系。其中長白山國家級自然保護區以其完整的森林生態系統和生物多樣性及其種質基因庫著稱于世，天池、瀑布、溫泉、峽谷、奇峰、花卉和植被垂直帶譜聞名遐邇。2013年開始，每年舉辦長白山生態國際論壇，很多國內外科研、學術機構的專家、學者來到長白山進行學術交流，長白山已成為馳名中外的旅游勝地和對外開展科技與文化交流的重要窗口；向海國家級自然保護區1992年被國務院指定列入《國際重要濕地名錄》，同年被世界野生生物基金會評定為“具有國際意義的A級自然保護區”，1993年被中國人與生物圈委員會批準納入“生物圈保護區網絡”，在國際濕地領域具有重要位置；琿春東北虎國家級自然保護區是我國第一個以國際瀕危物種、國家I級重點保護野生動物-東北虎、豹及其棲息地為主要保護對象的自然保護區，是我國野生東北虎、豹分布數量與密度最高的地區。

　　現有森林公園57個，其中國家級35個，省級22個，森林公園總面積258萬公頃，占吉林省國土總面積的13.76%。經過多年發展，森林公園建設初見成效，打造了“中國·長春凈月潭瓦薩國際滑雪節”“吉林·龍灣野生杜鵑花卉旅游節”“吉林·拉法山紅葉節”具有代表性的精品節慶活動，并在國家林業局舉辦的一系列評選中獲得殊榮，拉法山國家森林公園被國家林業局評為“中國最具影響力的森林公園”，凈月潭、龍灣、五女峰、露水河國家森林公園在2013年全國森林旅游系列推選活動中入選最美森林旅游景區100強，龍灣群國家森林公園作為中國國家森林公園的唯一代表，成功入選“IUCN全球最佳管理保護地綠色名錄”。

　　全省林業系統自然保護區和森林公園在保護生物多樣性、維系區域生態平衡、強化生態安全、加強科普教育，實施可持續發展戰略等方面發揮了重要的功能作用。